Débuter avec RStudio

Pourquoi RStudio ?

Le logiciel de statistiques R fonctionne en console. Ceci rend son approche délicate.

l’interface graphique RStudio, disponible sur tous les systèmes, permet d’utiliser plus aisément les possibilités de R.

Une interface en quatre zones

La console : c’est là que seront affichées les commandes exécutées ainsi que les résultats non graphiques.
Un éditeur : on pourra visualiser les fichiers de données, mais aussi éditer des scripts.
Un afficheur de variables et d’historique : on y retrouvera la listes des variables et des fonctions globales utilisées, ainsi que l’historique de toutes les commandes.
Un navigateur : pour accéder facilement

  • aux fichiers
  • aux graphiques
  • aux paquets
  • à l’aide

Choisir son répertoire de travail

Il est important de définir le répertoire de travail pour accéder aux fichiers, mais aussi pour les sauvegardes.

On peut le faire par le navigateur de fichiers. Il suffit de se placer dans le dossier voulu et d’utiliser le menu «More->Set as Working Directory».

On voit alors dans la console la commande équivalente :

setwd("~/monchemin")

Charger un fichier de données

On utilise le plus souvent un fichier csv, lui-même issu d’un tableur.

Pour importer les données, on peut utiliser l’afficheur de variables et choisir «Import data set -> From Text File».

On peut alors choisir le nom de la variable, mais aussi le séparateur utilisé. On voit alors un aperçu des données.

Dans la console apparaît la commande correspondante :

donnees <- read.csv("~/fichier.csv", sep=";")

Les scripts

Dans l’éditeur, on peut créer un fichier de type script (d’extension .r).

On y placera les commandes à exécuter et des lignes de commentaires commençant par un dièse.

On peut exécuter une ligne du fichier en plaçant le curseur sur cette ligne et en cliquant sur le bouton «Run».

On peut aussi exécuter toutes les commandes en cliquant sur le bouton «Source».